Železničná spoločnosť Slovensko, a. s. (ZSSK) vzhľadom na neprejazdnú trať zaviedla náhradnú autobusovú dopravu v úseku Margecany – Krompachy. Vlaková doprava na trase Margecany - Košice a späť je zabezpečená taktovou dopravou, vlaky zastavujú vo všetkých železničných staniciach a zastávkach.

Vlaky prichádzajúce od Žiliny končia cestu v Krompachoch. Súpravy sa použijú na zostavenie vlakov naspäť v smere na Žilinu.